Les services de gestion d'animalerie sont indispensables pour les laboratoires de biotechnologies ou de l'industrie pharmaceutique disposant d'animaux réservés à l'expérimentation. Des logiciels spécialisés de gestion d'animalerie de laboratoire sont commercialisés afin de faciliter l'administration de l'animalerie. Ils permettent de gérer en temps réel une base de données des animaux présents permettant de connaître précisément le nombre d'animaux à disposition et leurs caractéristiques. Un tel logiciel est également conçu pour suivre les expérimentations pratiquées sur les animaux et assurer la traçabilité de chaque animal.
La gestion de l'animalerie doit également prendre en compte l'environnement dans lequel évolue les animaux afin de leur apporter les meilleures conditions de vie, dans le respect des normes communautaires concernant l'expérimentation animale.
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